ด้วย มหาวิทยาลัยแม่ฟ้าหลวงกำหนดให้นักศึกษาระดับบัณฑิตศึกษาจะต้องดำเนินการจัดทำดุษฎีนิพนธ์ วิทยานิพนธ์ และการค้นคว้าอิสระก่อนสำเร็จการศึกษา โดยในกระบวนการการจัดทำนั้นมีขั้นตอนต่าง ๆ อาทิ การกำหนดหัวข้อ วัตถุประสงค์ กลุ่มเป้าหมาย วิธีการดำเนินการวิจัย การประมวลผล การสรุปและอภิปรายผล ซึ่งในแต่ละขั้นตอนมีวิธีการและกระบวนการที่ผู้วิจัยจะต้องตระหนักถึงเพื่อให้ได้ผลการวิจัยที่สะท้อนความเป็นจริงและตอบวัตถุประสงค์ที่ตั้งไว้
การเลือกหัวข้อและการออกแบบงานวิจัยนับเป็นอีกหนึ่งขั้นตอนที่สำคัญอย่างยิ่งของการทำดุษฏีนิพนธ์ วิทยานิพนธ์ และการค้นคว้าอิสระ ที่นักศึกษาจะต้องเลือกให้ตรงประเด็น สะท้อนเนื้อหาทั้งหมดของการทำวิจัยตอบโจทย์เบื้องต้นของการทำวิจัยได้ อาทิ สนใจเรื่องอะไร ทำไมถึงสนใจเรื่องนี้ จะหาข้อมูลได้จากที่ใด มีวิธีการใดที่จะได้ข้อมูลนั้นมา จะเรียนรู้และวิเคราะห์ข้อมูลนั้นอย่างไร การวิจัยนั้นจะก่อให้เกิดประโยชน์ด้านใด เป็นต้น